耳朵方面的疾病也是带猫咪去看兽医的原因，尤其当猫咪耳朵搔痒超过一星期以上时更要小心。常见造成耳朵搔痒的原因有虱子寄生在耳道中，细菌或霉菌感染等。虱子当然不止寄生在耳道中，但若寄生在猫咪耳朵中时，猫会剧烈的甩头及搔耳朵。虱子也会传染给狗，但对人不具传染性。兽医可用显微镜来观察猫耳中之分泌物，来判断是何种原因造成搔痒，同时医生也会用耳底镜来观察猫耳道及耳鼓是否正常。若病因是虱子，只要适当的治疗便可治愈。通常耳朵方面的疾病会以口服药或药膏来治疗。而饲主平时清理猫咪耳朵时也要小心，避免伤害耳鼓或误将棉球留在耳朵中而造成感染。